베네치아의 번잡함에서 벗어나 고요함 속에서 영적인 평화와 역사적 성찰의 시간을 갖고자 하는 개인 여행객이나 소규모 그룹이 주로 찾는다. 특히 프란체스코 성인의 발자취를 따라 조용한 명상과 기도를 원하는 이들에게 의미 있는 장소이다.

방문객들은 수사들의 안내를 받아 유서 깊은 수도원의 회랑과 교회를 둘러볼 수 있으며, 아름답게 가꿔진 정원을 거닐며 베네치아 석호의 독특한 풍경을 감상할 수 있다. 또한, 이곳에서 단기 피정을 하며 일상에서 벗어나 특별한 영적 체험을 할 수도 있다.

이탈리아어를 구사하지 못하는 방문객의 경우, 수도원의 일부만 둘러볼 수 있고 제공되는 정보가 제한적일 수 있다는 점이 아쉬움으로 언급된다.

섬의 이름 '산 프란체스코 델 데세르토'에서 '델 데세르토(del Deserto)'는 '사막의' 또는 '버려진 곳의'라는 뜻으로, 15세기경 말라리아와 같은 열악한 환경 때문에 섬이 한동안 버려졌던 역사에서 유래되었다는 얘기가 있다.

전설에 따르면, 성 프란체스코가 이곳에 머물 때 새들이 그의 설교를 듣기 위해 지저귀는 것을 멈췄다는 이야기가 전해진다.

성 프란체스코가 섬을 떠나기 전 자신의 지팡이를 땅에 꽂자 그 자리에서 나무가 자라났다는 전설도 있으며, 현재 수도원에는 그 흔적으로 여겨지는 오래된 나무둥치가 남아있다는 언급이 있다.

과거 이 섬은 '두 개의 포도밭 섬(Isola delle Due Vigne)'이라는 이름으로 불리기도 했다고 한다.

수도원 내부에는 방문객들이 자신의 생각이나 기도 제목을 남길 수 있는 큰 방명록이 비치되어 있다고 한다.