전승에 따르면 파비아의 첫 주교 성 시로에 의해 초기 기독교 바실리카로 건립되었다. 로마 시대 교외 묘지 근처에 세워진 것으로 추정된다.

밀라노의 암브로시우스 주교가 발견한 성 제르바시오와 프로타시오 순교자의 유물 일부가 인벤치오 주교에 의해 파비아로 옮겨져 이 교회에 봉헌되었다.

1949년 고고학 조사를 통해 교회 앞 광장에서 5세기와 6세기 사이의 초기 기독교 바실리카 구조, 특히 후진(앱스)의 일부가 발견되었다.

롱고바르드 왕국의 클레피 왕과 아우타리 왕이 이 교회에 매장되었다.

클뤼니 베네딕토회가 교회를 관리하며 로마네스크 양식으로 전면 재건축하였다. 현재의 종탑과 건물 측면의 일부 벽 구조가 이때의 것이다.

카시노 베네딕토회가 클뤼니 베네딕토회를 대신하여 교회를 관리하게 되었다.

수도원 건물의 일부가 지롤라모 에밀리아니에게 양도되어 고아들을 위한 시설로 사용되었다.

교회가 세속 프란치스코회 소속 수도자들에게 넘어갔다.

교회가 급진적인 개축을 거치면서 가장 큰 변화로 건물의 입구 방향이 반대로 바뀌었다. 이로 인해 로마네스크 양식의 파사드가 철거되고 새로운 후진(앱스)이 되었으며, 원래 후진 자리에는 새로운 파사드가 세워졌다.

나폴레옹 시대에 본당 자격을 잃고 산타 마리아 델 카르미네 교회의 부속 성당이 되었다.

산타 마리아 델 카르미네 교회로부터 독립하여 다시 본당의 지위를 회복하였다.