프란시스코 고야의 독창적인 프레스코 천장화와 그의 무덤을 직접 보고자 하는 미술 애호가 및 역사·문화 탐방객들이 주로 찾는다. 특히 고야의 예술 세계를 깊이 있게 경험하려는 이들에게 의미 있는 장소이다.

방문객들은 예배당의 돔과 천장을 가득 채운 고야의 걸작 프레스코화를 감상할 수 있으며, 제단 앞에 마련된 그의 무덤에서 추모의 시간을 가질 수 있다. 또한, 설치된 거울을 통해 높은 곳의 그림들을 보다 편리하게 자세히 관찰하는 것이 가능하다.

내부 사진 촬영이 금지되어 있으며, 설명 자료가 스페인어로만 제공되는 경우가 있어 아쉬움을 남긴다. 간혹 단체 관람객으로 인해 입장 대기가 발생하거나 예고 없이 임시 휴관하는 경우도 있다.

프란시스코 고야의 유해가 프랑스 보르도에서 이곳으로 이장될 당시, 그의 두개골이 없었다는 미스터리한 이야기가 전해진다. 스페인 영사는 이 사실을 마드리드에 보고했고, "머리가 있든 없든 고야를 보내라"는 답신을 받았다고 한다.

매년 6월 13일 성 안토니오 축일에는 젊은 미혼 여성들이 좋은 배우자를 찾기 위해 예배당을 찾아 기도하고, 세례반에 13개의 핀을 던지는 전통 풍습이 있다. 핀이 손에 많이 붙을수록 그해에 많은 구혼자를 만난다는 속설이 있다.

고야는 이 예배당의 프레스코화를 단 6개월 만에 완성한 것으로 알려져 있으며, 이는 그의 천재적인 작업 속도를 보여준다.

프레스코화의 내용은 성 안토니오가 죽은 사람을 살려내어 살인 누명을 쓴 자신의 아버지를 변호하는 기적 이야기인데, 고야는 이 장면의 배경을 13세기 리스본이 아닌 동시대의 마드리드로 설정하여 현실감을 더했다.

예배당의 프레스코화 보존을 위해 바로 옆에 똑같은 모습의 '쌍둥이 예배당'이 세워졌는데, 현재 종교 의식은 이 새로운 예배당에서만 거행되며 원본 예배당은 박물관으로만 운영된다.