스페인 의학의 역사와 발전에 깊은 관심이 있거나 마드리드의 유서 깊은 건축물에 매력을 느끼는 학술 탐방객 및 일반 방문객들이 주로 찾는다.

방문객들은 19세기 말에서 20세기 초 역사주의 양식으로 지어진 건물 내부와 아름다운 원형 강당, 중요한 의학 서적을 소장한 도서관 등을 관람할 수 있으며, 주기적으로 열리는 의학 관련 소규모 임시 전시도 접할 수 있다.

일부 방문객들은 웹사이트 등에서 기대했던 박물관으로서의 전면적인 개방이나 풍부한 상시 전시와 달리, 실제 운영은 소규모 임시 전시 중심으로 이루어지거나 특정 프로그램 위주로 진행되는 경우가 있어 아쉬움을 나타내기도 한다. 따라서 방문 전 공식 채널을 통해 개방 여부 및 현재 진행 중인 내용을 확인하는 것이 좋다.

이 기관의 기원은 1733년 여름, 마드리드의 의사, 외과 의사, 약사들이 의학 주제를 토론하기 위해 모였던 사적인 모임에서 비롯되었다는 이야기가 있다.

1734년 펠리페 5세 국왕의 왕령으로 공식 설립되었으며, 왕실의 보호를 받으면서 '왕립(Royal)' 칭호를 얻게 되었다고 전해진다.

현재의 '스페인 왕립 국립 의학 아카데미'라는 명칭은 1861년 새로운 규약과 함께 정해진 것으로 알려져 있다.

한때 '인판타 마르가리타 의학 박물관(Museo de Medicina Infanta Margarita)'이라는 이름의 박물관 건립 프로젝트가 논의되었으나, 현재까지 완전히 실현되지는 않았다는 언급이 있다.

아카데미의 모토는 "Ars cum natura ad salutem conspirans"로, "건강을 위해 자연과 협력하는 예술(의술)"이라는 의미를 담고 있다고 한다.

산티아고 라몬 이 카할, 세베로 오초아 등 노벨상 수상자를 비롯한 저명한 의학자들이 이 아카데미의 회원이었다는 사실이 알려져 있다.